Hola compi!!
a ver te comento por partes:
SPB 3.5
mas personalizable, mas bonito, muy fluido existen mas skins y tal.. en general permite mas opciones. Pegas, pesa más.. es decir, si tienes únicamente el spb instalado tienes un 45 mb libres ok? si le pones Sense o ProPlus Elegance que son dos skins te quedas en 20-25 megas de ram libres que es muy poco.. pero poquísimo!!
TF3D
menos vistoso, menos personalizable.. mas antiguo, para mi gusto menos fluido que el otro. Principal ventaja.. los casi 60 megas que te deja libres para que ejecutes lo que quieras...
esos datos son mas o menos objetivos, habrá quien difiera. en mi experiencia personal, tener el SPB instalado sin ninguna skin te garantiza una bonita interfaz totalmente presonalizable y con 45 MB de ram libres que son mas que suficientes para lo que utilizo ;)
la elecion es diseño o rendimiento, tu como lo ves?